Su presidencia tuvo un periodo desde 1958 hasta 1962, Frondizi envió a Caracas a su colega Rogelio Frigerio para concretar un pacto con Perón, en donde Perón se comprometía a asegurarle el triunfo electoral con el fin de anular las leyes de prohibición del peronismo.
Frondizi asumió el 1° de mayo y días después envió al congreso un proyecto de Ley de Amnistía para los presos políticos peronistas y al poco tiempo el proyecto de Asociaciones Profesionales, devolviendoles el poder a los gremios peronistas.
Frondizi estaba cumpliendo con el acuerdo con Perón pero al poco tiempo se empezó a sentir presionado por las corporaciones tradicionales con mayor poder: La Iglesia y Los Militares.
- Situación con la Iglesia:
La Iglesia intervino durante el debate sobre la Ley de Educación Superior que permitía a las universidades privadas otorgar títulos habilitantes, en su gran mayoría de la mano de la Iglesia Católica.
El movimiento estudiantil argentino se opuso a las universidades privadas y organizo un plan de movilización junto el apoyo de los sindicatos, los estudiantes secundarios y los partidos políticos de la oposición bajo el lema "Laica o Libre". Los estudiantes defendían la bandera "Laica" contra la ley de Educación Superior,mientras que el gobierno y la Iglesia católica defendían la bandera "Libre".
- Situación con las Fuerzas Militares:
Frondizi durante su gobierno debió actuar por un lado, con el poder militar y, por otro, con el poder peronista que lo demandaba por su participación electoral y por el pacto ya realizado.
Existió permanentemente una contradicción entre Frondizi y las Fuerzas Armadas. A partir de la modificación de ley de ministerios las Fuerzas Armadas comenzaron a intimidar al gobierno con el fin de que este accediera a sus presiones. Así las fuerzas armadas no dejaron de manejar el poder; agotando las diversas formas de presión militar. Ante esto Frondizi intento negociar con los sublevados con el fin de seguir con su objetivo principal: El Desarrollismo Económico.
Frondizi creó el Plan CONINTES,que le permitía declarar zonas militarizadas a los principales centros y autorizaba a las Fuerzas Armadas a realizar allanamientos y detenciones sin cumplir las normas constitucionales.
- Aspecto Económico
Frondizi intentó llevar a cabo una reforma agraria que modificara el sistema de propiedad. Sostuvo que el mal de la Argentina era su condición de país subdesarrollado y que para solucionarlo lo fundamental era la creación de bienes. El ahorro interno no era suficiente para financiar el crecimiento económico.
Los pilares de esta concepción son la intergración y el desarrollo, siendo que la integracion causa necesaria para alcanzar el desarrollo nacional.
Para el Desarrollismo, los partidos políticos debían ser excluidos de la acción del gobierno y del programa frondizista, ya que si estos actuaban por si mismos,nunca se llegaría a lograr la integracion nacional, siendo ésta sólo posibles través de la participacion de los distintos sectores sociales.
- Aspecto social